簡單重復(fù)序列（simple sequence repeat, SSR）又稱作微衛(wèi)星序列（microsatellite, MS），是一類由1-6個核苷酸為基本單位多次重復(fù)而形成的DNA片段。SSR數(shù)量豐富、多態(tài)性高、均勻覆蓋整個基因組、呈共顯性遺傳且檢測簡單，因此被作為第二代分子標記廣泛應(yīng)用于遺傳圖譜構(gòu)建、目標基因定位、遺傳多樣性研究、分子輔助育種、種質(zhì)資源鑒定等領(lǐng)域。
傳統(tǒng)的SSR檢測流程一般為PCR后跑膠、染色、人工分析，其步驟繁瑣且需要占用大量的人力和時間。
Agilent ZAG DNA分析儀是一款基于96道平行毛細管的自動化電泳系統(tǒng)，可全自動完成灌膠、上樣、跑膠和批量結(jié)果分析，大大解放您的人力和時間。
ZAG DNA分析儀
1 高通量
ZAG DNA分析儀采用96道平行毛細管，一次同時運行96個樣品。具有9個放96孔樣品板的位置，可在無人值守的情況下連續(xù)運行9塊96孔板即864個樣品。
2 快速
最快20min即可完成96個樣品的電泳分離（ZAG-135 dsDNA kit），24 小時內(nèi)可處理 48塊96 孔板即4608個樣品。
3 分辨率高達3bp
可輕松實現(xiàn)僅3 bp差異的DNA片段（300bp以內(nèi)）的分離和分子量測定。
4 多樣化的結(jié)果
ZAG DNA分析儀的結(jié)果包括數(shù)字化膠圖、電泳譜圖及可自定義分析的數(shù)據(jù)表，結(jié)果可導(dǎo)出CSV及PDF格式。
5 批量數(shù)據(jù)處理
ZAG DNA分析儀采用ProSize分析軟件，其批量處理模式可比較同一次運行或多次運行中的片段的分子量大小、峰高和分離譜圖等，可同時處理超過100個樣品板。通過邏輯運算AND、OR、AND NOT、NOR等自定義分析Flag，軟件可自動輸出邏輯運算結(jié)果，從而實現(xiàn)批量分型分析。
注：0=false，1=true
實例圖展示
Anju Biswasa等發(fā)表在Scientia Horticulturae上的題為“Characterization of strawberry (Fragaria spp.) accessions by genotyping with SSR markers and phenotyping by leaf antioxidant and trichome analysis”的文章中利用 35 個 SSR 標記對 33 個草莓品種進行基因分型，以觀察所研究品種之間的遺傳多樣性或相關(guān)性。其中SSR分析采用了Fragment Analyzer片段分析儀及PRO Size?2.0軟件。（注：Fragment Analyzer片段分析儀與ZAG DNA分析儀同樣采用96道并行毛細管的原理，但只能連續(xù)運行3塊96孔板）
33 種草莓FAC-016 引物（35種引物的一種）的SSR擴增結(jié)果。Lower Marker為35bp, upper Marker為500bp。
Agilent ZAG DNA分析儀為您提供自動化、高通量、快速的SSR電泳和分析。